בארבע השנים האחרונות מוביל מנכ"ל משרד ראש הממשלה, באמצעות האגף לתכנון מדיניות, את תהליך הכנתן של תוכניות העבודה והערכות המצב המשרדיות. מעגל התכנון עצמו נבנה לאור תובנות שעלו מסדרת דיונים שקיים האגף באוגוסט 2007 עם גורמי תכנון ותקצוב במשרדי הממשלה. במפגשים אלו, התברר שכמעט ולא מתקיים סנכרון בין תהליך התכנון לבין תהליך התקצוב בשנת העבודה השוטפת. התהליך מעגן, הלכה למעשה, הליך מסודר של קבלת החלטות והתוויית כיווני פעולה ברמה המשרדית, כחלק ממהלך ממשלתי כולל.

מעגל התכנון והתקצוב השנתי. (מתוך: מדריך התכנון הממשלתי).
תוכניות העבודה השנתיות: סיומו של התהליך השנתי בכנס של המנהלים הכלליים של משרדי הממשלה אשר בו מוצגים עיקרי תוכניות העבודה השנתיות (2007 / 2008 / 2009). בשנת 2007 פורסמו עיקרי התוכניות במסמך מסכם שערך והפיק משרד ראש הממשלה, ובשנים שלאחריה הוקם אתר אינטרנט ייעודי הפתוח לציבור ובו מצגות המשרדים וקטעי וידאו מהכנס.
הערכות המצב השנתיות: בנוסף לתוכנית השנתית, במהלך החודשים אפריל-מאי 2008, לפני תחילת דיוני תקציב 2009 קיימו 17 משרדי ממשלה תהליך לגיבוש הערכות מצב משרדיות, בהתאם לעקרונות ולשלבים שבמדריך התכנון הממשלתי. אחד מיעדי המהלך היה הקדמת התכנון לתקצוב, לצורך גיבוש החשיבה על שינויי הכיוון הנדרשים בתוך המשרדים. חלק מהמשרדים הציגו את תוצאות הערכת המצב למנכ"ל משרד ראש הממשלה ועשו בה שימוש כחלק מדיוני התקציב. המסמכים עצמם משמשים בסיס לגיבושה של הערכת המצב הלאומית, במסגרת עבודה משותפת לאגף לתכנון מדיניות ולמועצה לביטחון לאומי. חלק מהתובנות שנגזרו מהם כבר הוצגו בפני מקבלי ההחלטות.
