המשנה למנכ"ל אחראי על מתן מענה לצרכים ארגוניים, הנגזרים ממשימות רה"מ והאתגרים העומדים בפני ממשלת ישראל.

המשנה למנכ"ל מופקד על התחומים:
משאבי אנוש, הדרכה ורווחת העובד;
משאבים חומריים (בנא"מ);
מערכות מידע ומיחשוב;
ביטחון;
אירועים;
ותקציבים.

יחידות המינהל ערוכות למתן מענה כולל לצרכים ארגוניים כנ"ל, ומטרתן לאפשר לממשלת ישראל וליחידות המשרד לבצע את מטלותיהן על ידי מתן שירותים תומכים, תוך מחוייבות לספק שירות איכותי.

יחידות המינהל פועלות על פי התפיסה, כי המשאב היקר ביותר של המשרד הינו המשאב האנושי - עובדות המשרד ועובדיו. התפיסה המציבה את העובד במרכז באה לידי ביטוי בניסיון להעמיד חבילת שירותים מגוונת לטובת העובדים. הכוונה להשקעה בהתמקצעות העובד הכוללת הכשרה מקצועית, עידוד לרכישת השכלה גבוהה וגמול השתלמות. כמו כן, מדובר בדאגה מתמדת לרווחת העובד תוך הטיית אוזן קשבת וסיוע פרטני לפתרון בעיות אישיות וכן בהשבחה מתמדת של תנאי העבודה הפיסיים במתקני המשרד.

במסגרת תפקידו עומד המשנה למנכ"ל בראש הועדות המשרדיות: מכרזים, מענקים (הדרכה), ענ"א, תמיכות, חניה, בחירת העובד המצטיין, הענקת פרסי ייעול, בחירת הנהג המצטיין והועדה המשרדית למחקרים, סקרים והעסקת יועצים.

נוסף על כך,  מבצע המשנה למנכ"ל משימות מיוחדות בכפוף להנחיות מנכ"ל משרד ראש הממשלה.

לינק שבןר