בנימין זאב הרצל נפטר באוסטריה ביום כ' בתמוז תרס"ד (3 ביולי 1904). בצוואתו ביקש הרצל להיקבר ליד אביו בוינה, עד אשר העם היהודי יעלה את גופתו ואת גופות בני משפחתו לארץ ישראל.

ביום ט"ו באב תש"ט (10 באוגוסט 1949) חוקקה הכנסת הראשונה את חוק העלאת עצמותיו של הרצל, כאקט חגיגי של מילוי צוואתו של בנימין זאב הרצל.

שלושה ימים לאחר מכן יצאה משלחת מטעם המדינה לאוסטריה. ביום כ"א באב תש"ט (16 באוגוסט 1949) נתקבלו בארץ בטקס ממלכתי ארונו של הרצל וארונות הוריו. למחרת הובא ארונו של הרצל לירושלים ונקבר בהלוויית המונים בחלקה מיוחדת שהוכשרה על פסגת הר גבוה בירושלים, שנקרא מאז ואילך בשם הר הרצל.
מאז הובא הרצל לקבורה בישראל מקיימת המדינה מדי שנה אזכרה ממלכתית לזכרו ביום השנה לפטירתו, כ' בתמוז.

בשנת 1924 עלו שבעה חלוצים לאדמות שרכש יהושע חנקין וייסדו את המושבה שלימים הפכה לעיר הרצליה, ששמה וסמליה נקבעו לציון ולזכר חזונו הציוני של הרצל. בתי ספר רבים ברחבי ישראל קרויים על שמו של הרצל וכמעט בכל עיר ניתן למצוא רחוב הקרוי על שמו של חוזה המדינה.

מפעל ההנצחה המרכזי להנצחת פועלו של הרצל הוא מוזיאון הרצל שבהר הרצל. באביב תשס"ה נחנך בהר הרצל על ידי ההסתדרות הציונית העולמית מרכז הרצל הכולל את המוזיאון המחודש והמרכז ללימודי ציונות.

ביום י' בתמוז תשס"ד (29 ביוני 2004), לקראת יום השנה המאה למות הרצל, חוקקה הכנסת את חוק בנימין זאב הרצל (ציון זכרו ופועלו). החוק שהוגש על ידי חבר הכנסת אילן שלגי, יו"ר ועדת החינוך והתרבות של הכנסת דאז, זכה לתמיכה רחבה ועבר ללא התנגדות.
מטרת החוק הינה להנחיל לדורות את חזונו, מורשתו ופועלו של בנימין זאב הרצל, לציין את זכרו ולהביא לחינוך הדורות הבאים ולעיצוב מדינת ישראל, מוסדותיה, יעדיה ודמותה בהתאם לחזונו הציוני. מטרות אלו ייושמו ע"י קיום פעילויות חינוכיות-ערכיות במוסדות המדינה, בצה"ל ובבתי הספר וע"י מתן מלגות לתלמידים ומתן תמיכות כספיות מאוצר המדינה למוסדות ציבור, הפועלים להגשמת מטרות החוק.

החוק קובע כי אחת לשנה, בי' באייר, יום הולדתו של בנימין זאב הרצל, יקוים בישראל יום הרצל. ביום זה יתקיים טקס ממלכתי בהר הרצל בירושלים,  בבתי הספר ובמחנות צה"ל יוקדש זמן ללימוד פועלו וחזונו הציוני ויתקיים בירושלים כנס לזכרו של הרצל, בו יידונו נושאים מעולם הציונות ברוח חזונו. החוק קובע גם כי הכנסת תקיים דיון מיוחד לציון יום הרצל ביום זה או במועד סמוך אליו.

המועצה הציבורית להנצחת זכרו של בנימין זאב הרצל הוקמה על פי החוק לשם יישומו. המועצה פועלת מתוך משרד ראש הממשלה וחבריה ממונים על ידי ראש הממשלה. המועצה בהרכבה המלא מונה 21 חברים, ובהם נציגי משרד ראש הממשלה, משרד הביטחון, משרד החינוך התרבות, צה"ל, ההסתדרות הציונית העולמית ונציגי ציבור. יו"ר המועצה המכהן הוא ד"ר דניאל פוליסר המשמש כנשיא מרכז שלם.

תפקידי המועצה הציבורית הם לייעץ לראש הממשלה בכל הנוגע ליישום החוק, להמליץ על מדיניות ויעדים לעניין הפעילות לפי הקבוע בחוק ולעקוב אחרי ביצועו. להכין ולהגיש לראש הממשלה ולשר האוצר הצעת תקציב שנתי להשתתפות אוצר המדינה בהפעלת החוק. לייעץ לראש הממשלה לעניין קביעת מבחנים לתמיכה מאוצר המדינה במוסדות ציבור לשם קידום מטרות החוק, ובין השאר בקשר לקיום פעילות בהר הרצל בירושלים ולשימור, שחזור והצגה של מוצגים ומסמכים הקשורים לחייו ולפועלו של הרצל.

משרד ראש הממשלה הוא הרשות המבצעת הממונה על ביצוע החוק והתקציב להפעלתו ייקבע בחוק התקציב השנתי הנחקק בכנסת.